Si creaste un pendrive de instalación de Ubuntu con la herramienta de creación de discos de arranque, es posible que te hayas encontrado con la imposibilidad de borrarlo. La solución es muy fácil.
Conecta el pendrive y abre la herramienta Discos.
Selecciona el dispositivo y en el icono de los engranajes selecciona Editar las acciones de montaje.
Ahora pulsa en el recuadro derecho en Opciones de montaje automático
Cierra la ventana, desconecta el dispositivo y vuelve a conectarlo.
Ya puedes formatearlo.
Fuente: planetadiego