En muchos de los nuevos smartphones solo se pueden transferir archivos (con cable usb) mediante MTP. Es muy sencillo conseguir soporte para este protocolo desde nautilus.
En Archlinux:
sudo pacman -S gvfs-mtp
Y ahora reinicia nautilus
nautilus -q
En Ubuntu desde la versión 13.10 viene con soporte por defecto.
Más información: Wiki Archlinux
Fuente: eduardoparra